Störningarna anses handla om avsiktlig signalmanipulering som leder till att fartygens position ser ut att hoppa fram och tillbaka, enligt myndigheten.
– Vi har inte sett det så här ofta och så här många rapporter i mellersta Östersjön, säger Sebastian Wigmo, presstalesperson på Sjöfartsverket till tidningen.
Säkerheten på sjön ska inte påverkas av störningarna, men Sjöfartsverket har skickat ut en navigationsvarning.
– Vi uppmanar till extra försiktighet, säger Wigmo.
Ryssland har tidigare pekats ut som ett land som troligtvis ligger bakom GPS-störningar på Östersjön, skriver Aftonbladet.