Den femtonåriga pojken är ännu inte förhörd.
– Han hade haft den framme så andra elever sett den och blivit rädda, säger Urban Schill, förundersökningsledare vid Nyköpingspolisen.
Elever pratade med den polispatrull som redan var på skolan och poliserna konfronterade eleven med uppgifterna.
– De hittade pistolen efter att ha pratat med eleven.
Eleven ska inte ha avlossat skott eller hotat någon med vapnet.
– Han kommer att förhöras. Vi har tagit vapnet i beslag och ska lämna det för teknisk undersökning och fastställa vilken styrka det har.
Ytterligare en pojke ska ha ertappats med en softairgun på fredagen.
– Han var under femton så det blir ett ärende för socialen, säger Urban Schill.
I år har polisen hanterat ett antal ärenden där minderåriga haft softairguns.
– Det har hänt att ungdomar skjutit mot andra ungdomar, då är det misshandel. Många softairguns är väldigt verklighetstrogna och man ska definitivt inte ha dem på skolor. Dessutom är det artonårsgräns, säger Urban Schill.