Thörn tillträder det nya jobbet den 1 mars.
– Det känns som Anna matchar det som behövs för att Söderköping ska fortsätta att vara det smultronställe det är idag, men även utvecklas för att möta nuvarande och kommande invånares behov, säger kommunalrådet Anders Bevemyr (S) i en kommentar på Söderköpings hemsida.
Enligt honom har tjänsten lockat "många kompetenta sökande".
När SN når Anna Thörn vill hon inte ge någon kommentar till varför hon slutar, utan ber om att få återkomma senare i veckan.
– Jag är på väg in i ett möte men tror att jag behöver några dagar att tänka efter lite innan så jag vet hur jag ska uttrycka mig, säger hon.
Anna Thörn är född och uppvuxen i Norrköping och bor i Åby. Hon har jobbat som divisionschef för barn- utbildning och kultur i två år. Divisionen har haft förhållandevis stor omsättning på chefer de senaste åren.
Erik Carlgren, kommundirektör i Nyköping, fick beskedet i fredags.
– Chefer stannar kortare tid nu jämfört med förr. Så är det nog i hela kommunsverige. Anna Thörn har varit här i två år och det är naturligtvis inte optimalt – men möjligheter öppnas när de öppnas och inte när man planerar, säger han.
Anna Thörn har höjt sin lön med över 6000 kronor under sina två år i Nyköpings kommun. Hon fick 67 000 kronor i månaden när hon började. Hennes nuvarande månadslön är 73 100 kronor.