Amadou Junior Tandia gjorde två och Anis Abdulkader ett mål för Vendelsö.
Vendelsö har två segrar, två oavgjorda och en förlust och 8-7 i målskillnad på de senaste fem matcherna, medan IFK Nyköping har en vinst, en oavgjord och tre förluster och 5-15 i målskillnad.
Efter fem matcher har Vendelsö nu åtta poäng och IFK Nyköping har fyra poäng.
Nästa motstånd för IFK Nyköping är Reymersholm. Lagen möts lördag 10 maj 13.00 på Rosvalla IP.