Matchen förblev jämn målmässigt till Syrianska tog ledningen i 24:e minuten, genom David Malki.
Syrianska gjorde också 0-2 alldeles före halvtidspausen, genom Marten Al Abdulawi.
Nyköping reducerade till 1-2 i 45:e minuten. Direkt efter pausen gjorde Oliver Markulic mål och ökade Syrianskas ledning.
Reduceringen till 2-3 kom på tilläggstid, när Pontus Nordenberg slog till och gjorde mål för Nyköping. Fler mål än så blev det inte för Nyköping.
Båda lagen har haft en tuff start på serien, och har tre poäng efter tre spelade matcher.
Nästa motstånd för Nyköping är FoC Farsta. Lagen möts torsdag 17 april 20.00 på Farsta IP.